A limpeza subaquática de navio é um dos trabalhos mais executados na Manutenção Subaquática de navios. A Seasub está equipada com modernos equipamentos hidráulicos com altos rendimentos de limpeza e escovas adequadas ao tipo de sujidade encontrada no casco, leme e hélice dos navios.
Existem, no entanto, restrições ambientais relativa a limpeza das águas vivas dos navios e estruturas flutuantes no território nacional.